浮游菌采樣器在使用前都需要對一系列的參數進行設定，為方便用戶使用，總結了一些參數的設定方法，按“功能”鍵進入參數設定狀態，各狀態參數的設定如下：
　　1、采樣量設定：在此狀態下按上下鍵可調整采樣量，采樣量范圍為10-6000升，調整步距為10升，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　2、采樣量校正：在此狀態下按上下鍵可調整采樣量校正值，即實測的每分鐘流量值。校正范圍為20-200升/分，調整步距為1升/分，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　3、對比度調節：在此狀態下按上下鍵可調整LCD顯示器的對比度，對比度范圍為0-3，按“停止”鍵退出參數設定，按功能鍵進入下一參數設定。
　　4、背光延遲時間設定：在此狀態下按上下鍵可調整背光延遲時間，背光延遲時間范圍為0-256秒，調整步距為1秒，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　5、時間設定：在此狀態下按上下鍵可調整當前光標所在位置的時間，按“確認”鍵可改變光標的位置，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　6、采樣延遲時間設定：在此狀態下按上下鍵可調整采樣延遲時間，采樣延遲時間范圍為0-256秒，調整步距為1秒，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　7、日期設定：在此狀態下按上下鍵可調整當前光標所在位置的日期，按“確認”鍵可改變光標的位置，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　8、清零設定：在此狀態下按上下鍵可調整清零狀態，在清零狀態下按“確認”鍵將會把內存中的歷史數據清除并退出參數設定狀態，按“停止”鍵退出參數設定，按“功能”鍵進入下一參數設定。
　　浮游菌采樣器只有在參數設定正常以后，才能進行精準的試驗分析。